Для того чтобы перенести сайт из подпапки в корень, необходимо сделать следующее:
Также необходимо проверить все прописанные в настройках сайта пути.
За более подробной инструкцией или рекомендациями по переносу также рекомендуем обращаться к сотрудникам платформы 1С-Битрикс по адресу www.1c-bitrix.ru/support.