Для установки порядка вывода SKU перейдите в настройки инфоблока торговых предложений на вкладку свойства и откройте настройки свойства по которому осуществляется выбор торговых предложений. Например в нашем случае это размер
Листаем вниз до значений списка. У каждого из значений есть сортировка, задаем сортировку нужным нам образом, например мы хотим чтобы размер Малый был последним:
Сохраняем настройки свойства, не забываем сохранить сам инфоблок, иначе настройки не применятся.
Посмотрим в карточке товара, порядок именно такой как мы задали:
